Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具基本簡介
Graphpad Prism 是一款優(yōu)秀的統(tǒng)計繪圖軟件,集生物統(tǒng)計、曲線擬合、科研繪圖于一體。軟件專門為科研工作者設計,可以輕松地進行統(tǒng)計分析并繪制統(tǒng)計圖,已被世界知名學府、科研機構(gòu)、醫(yī)學中心和制藥企業(yè)廣泛使用。Graphpad Prism 具有功能實用、操作便捷等特點,自推出以來受到了很多用戶的喜愛,該軟件集生物統(tǒng)計、曲線擬合和科學繪圖于一體,可以幫助醫(yī)學人員輕輕松松就可以制作出專業(yè)的醫(yī)學表。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件科普
非線性回歸是分析數(shù)據(jù)的重要工具,但往往比需要的難度更大。 沒有其他程序能像 Prism 那樣簡化曲線擬合。 事實上,你通常可以在一個步驟中適合曲線。 只需從常用方程式的廣泛列表中選擇一個方程式(或輸入您自己的方程式),Prism 會自動完成其余部分 – 適合曲線,以表格形式顯示結(jié)果,在曲線圖上繪制曲線,并插入未知值。將多個數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)并排放置在有組織的數(shù)據(jù)表上,而 Prism 可以一次將所有的數(shù)據(jù)集合在一起。 您可以分別將相同的模型擬合到每個數(shù)據(jù)集,使用全局非線性回歸在數(shù)據(jù)集之間共享參數(shù)值,或?qū)⒉煌哪P蛿M合到不同的數(shù)據(jù)集。
麻雀雖小五臟俱全,Prism 也為您提供了許多先進的配件選擇。它可以將最佳擬合參數(shù)的置信區(qū)間報告為非對稱范圍(P值相似方法),它比通常的對稱區(qū)間要精確得多。 它還可以自動插入標準曲線中的未知值(即分析RIA數(shù)據(jù)),使用F檢驗或Akaike信息準則(AIC)比較兩個方程的擬合,繪制殘差,識別異常值,差異重量數(shù)據(jù)點,測試正常性的殘差等等。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件功能
科技繪圖
1. 操作簡單快捷:
1.1 輸入數(shù)據(jù)后,軟件自動生成統(tǒng)計圖,無需專門繪制。
1.2 工具欄按鈕簡潔明了,一鍵式操作,包含了所有的繪圖和分析功能。
2. 圖片類型齊全:
2.1 能繪制各種類型的統(tǒng)計圖。
2.2 可以自定義圖片的各個細節(jié),得到漂亮的統(tǒng)計圖。
2.3 滿足科研數(shù)據(jù)繪圖的所有要求,包括誤差條、對數(shù)軸、不連續(xù)參數(shù)軸、希臘字符等。
3. 高質(zhì)量的圖片輸出:
3.1 支持多種格式的圖片輸出,包括高分辨率的TIF格式和EPS格式,滿足發(fā)表文章的各種需要。
3.2 運用Layout工具,將多個相關的統(tǒng)計圖排版到同一個頁面中
生物統(tǒng)計
1. 統(tǒng)計分析功能更加實用和精煉,能輕松地利用軟件進行實驗室和臨床研究所需要的統(tǒng)計檢驗,包括:T檢驗、nonparametric comparisons、單/雙因素方差分析、線性回歸、非線性回歸、列聯(lián)表分析、生存分析。
2. 提供完善的統(tǒng)計分析幫助系統(tǒng),點擊統(tǒng)計分析對話框中的“Learn”按鈕,打開對應的幫助資源,幫您選擇正確的統(tǒng)計方法。
曲線擬合
1. 非線性回歸方程齊全,具有強大的非線性回歸分析功能。
2.分析過程簡單,根據(jù)數(shù)據(jù)選擇正確的回歸方程后,軟件自動進行曲線擬合并生成結(jié)果表格以及繪制曲線圖。
3.能根據(jù)標準曲線自動計算樣本結(jié)果。
4. 能運用F檢驗或者Akaike’s Information Criterion對兩個擬合方程進行比較
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具特色功能
1. 自動生成誤差條:輸入重復樣本的數(shù)據(jù)后,軟件自動計算并在統(tǒng)計圖上生成誤差條,而不需要人為操作。
2. 同時分析多個相關實驗的數(shù)據(jù)。
3. 分析重復實驗的效率高:任何一次分析都可以作為其重復實驗的模板,導入重復實驗的數(shù)據(jù)后。
4.軟件自動進行數(shù)據(jù)分析并作圖。
5. 修正輸入的數(shù)據(jù),軟件能自動對其分析結(jié)果和統(tǒng)計圖進行同步修正。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具安裝步驟
1、在本站下載這款軟件的壓縮包,解壓后,雙擊exe文件,進入安裝界面,點擊browse可以修改默認在C盤的安裝位置,建議大家選擇安裝在D盤,然后點擊install
2、軟件正在安裝,我們耐心等待
3、軟件安裝成功,點擊finish即可
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具使用方法
1、數(shù)據(jù)的錄入
打開GraphPad Prism軟件后,軟件會讓操作者選擇數(shù)據(jù)的輸入類型,此時注意選擇“Column”這個選項。如圖2所示:
之后分別輸入兩組變量的值。如圖3所示,實驗組共5個樣本,檢測數(shù)值分別為1,2,3,4和5;對照組也是5個樣本,分別是4,5,6,7和8。也可以在表頭上對數(shù)據(jù)進行標識,分別為Experiments和Controls。如果此處不進行標識,默認的組名是Dataset A和Dataset B。
2、結(jié)果的運算
結(jié)果錄入完畢后,點擊菜單欄中的Analyze,會出現(xiàn)如圖4所示的界面。注意左側(cè)一定要選中”t tests (and nonparametric tests)”。
點擊圖4中的OK,會進入如圖5所示界面。在此界面中,軟件要求作者選擇是否配對(Paired和Unpaired),并決定選擇參數(shù)檢驗還是非參數(shù)檢驗。所謂參數(shù)檢驗就是指配對t檢驗或獨立樣本t檢驗,而非參數(shù)檢驗則是指Mann-Whitney U檢驗或配對Wilcoxon檢驗。如果選擇參數(shù)檢驗(默認兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布),軟件會讓操作者選擇方差是否齊。
如果方差齊,軟件會選擇t檢驗,如果不齊,軟件推薦Welch法。需要說明的一點是,如果兩組數(shù)據(jù)均呈正太分布,但方差不齊,此時應采用校正t檢驗,目前有三種主要的校正t檢驗法:Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism僅支持Welch法。
如果兩組數(shù)據(jù)不呈正太分布,則應該選用非參數(shù)檢驗。非參數(shù)的兩個選項分別是Mann-Whitney U檢驗和Kolmogorov-Smirnov檢驗。一般選擇Mann-Whitney U檢驗。
除了Experimental Design以外,還可以對Optional選項里面的內(nèi)容進行修改。如圖6所示。一般建議選擇“Discreptive statistics for each data set”(展示各組數(shù)據(jù)的均數(shù)、中位數(shù)、標準差、秩和等)選項。在P value一段,系統(tǒng)默認為雙尾檢驗,一般建議不要更改。
所有的選項選擇完畢后,點擊OK即可進行計算。
3、結(jié)果的解讀
結(jié)果一般分為兩個部分,一是差異是否具有統(tǒng)計學意義;二是差異有多大。如果研究者選擇了Mann-Whitney U檢驗,則可得到如圖7所示的結(jié)果。
參數(shù)分析結(jié)果的解讀與此類似,只不過多了個F test to compare variances,即方差是否齊。一般認為,P值大于0.10才可以認為兩組數(shù)據(jù)方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。
4、檢驗數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布
可能有的讀者會問GraphPad Prism能否判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。其實是可以進行正態(tài)分布檢驗的。以上述兩組數(shù)據(jù)為例,首先點擊Analyze,然后選擇XY Analysis下面的Column statistics。如圖8所示:
如圖9所示,GraphPad Prism提供了三種檢驗數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。針對同一種數(shù)據(jù),三種方法的計算結(jié)果大同小異。雖然GraphPad Prism不推薦用Kolmogorov-Smirnov法,但根據(jù)筆者經(jīng)驗,在國際上發(fā)表論文時,多采用Kolmogorov-Smirnov法的結(jié)果,可能是因為當樣本量太小時,Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法無法給出檢驗結(jié)果。當然,也可以三種方法都選擇,綜合判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。
選擇好統(tǒng)計方法之后點擊OK,就可以得到正態(tài)檢驗的結(jié)果,如圖10所示。需要特別說明的是:在正態(tài)檢驗中,一般認為P大于0.10才表述數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,兩組數(shù)據(jù)的P值均為0.20,因此可以認為兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具常見問題
用Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版軟件繪制散點圖及線性分析?
打開Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版,將Y右側(cè)的第一欄選中,點擊create。
分別在X和Group A下方對應的空白處輸入組別,并在X、Y下方輸入數(shù)據(jù)。
點擊Graphs下方的Data1,輸出圖片,選擇散點圖,點擊ok。
點擊Analyze,點擊線性回歸(Linear regression)。
點擊ok,彈出如下對話框,繼續(xù)點擊Ok,出現(xiàn)擬合好的直線圖。
繼續(xù)點擊analyze,開始進行相關性分析。將線性回歸改成相關性(correlation)。
點擊Ok,彈出如下對話框,繼續(xù)點擊ok。在結(jié)果中可以看到散點圖的Pearson r 相關性以及P value大小。
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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具更新日志
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