BioEdit軟件功能
1、可以完成核苷酸序列和蛋白質(zhì)序列進行所有常規(guī)的分析操作
2、序列比對、序列檢索、引物設計、系統(tǒng)發(fā)育分析等
3、與 DNAMAN 相比
4、其分析內(nèi)容相對更豐富一些
BioEdit軟件特色
1、點擊顏色表編輯
2、將序列分組成組或族。
3、獨立核酸和氨基酸顏色表的顏色對齊和編輯,并完全控制背景顏色。
4、鎖定序列以防止意外編輯。
5、動態(tài)的基于信息的對齊陰影。
6、為同步手對齊調(diào)整鎖定分組序列的對齊。
7、基本的系統(tǒng)發(fā)育樹查看器(phylip格式樹),允許節(jié)點翻轉(zhuǎn)和打印。
8、在包含特征注釋信息工具提示的對齊窗口中使用動態(tài)視圖對具有圖形特征的序列進行注釋。
9、用于從DNA序列自動生成質(zhì)粒載體圖的質(zhì)粒繪圖接口。輕松標記位置,添加箭頭和彎曲框的功能,并標記限制性酶切位點。同時顯示polylinker的細節(jié),繪制可移動的箭頭和繪圖工具的形狀。
10、在氨基酸和核苷酸序列中指定被認為有效的字符進行計算。
11、顯示和打印具有專業(yè)外觀的ABI色譜圖。
12、追加一個對齊到另一個的結(jié)尾。
13、手動對齊四種模式:選擇和幻燈片,動態(tài)抓取和拖動,間隙插入和鼠標點擊刪除,以及在屏幕上的打字行為就像一個文本編輯器。
14、按照名稱,LOCUS,定義,訪問,PID / NID,參考,注釋或選定列中的殘留頻率對序列進行排序。
15、通過參考序列合并對齊。
BioEdit安裝步驟
1.在本站下載BioEdit最新版安裝包,解壓后,雙擊“exe”文件,進入安裝向?qū)?,單擊Next
2.閱讀許可協(xié)議,點擊“I accept the...”,單擊Next
3.閱讀下列重要信息,單擊Next
4.輸入用戶信息,單擊Next
5.點擊“Change”選擇安裝位置,一般默認在C盤,推薦安裝在D盤,單擊Next
6.選擇安裝類型,單擊Next
7.軟件信息已準備就緒,單擊Install安裝
8.軟件正在安裝,請耐心等待
9.BioEdit安裝完成,單擊Finish,退出安裝向?qū)?
BioEdit使用方法
拼接教程:
1、在BioEdit中開啟一個序列
2、而后將序列上方的一個菜單:Mode下拉式菜單改為Edit,將光標移動到序列的最末端,從粘貼板上粘貼你要增加的第二個序列就OK了。這樣三個序列都前后連接到一起了。
3、這需要一個一個來,十分麻煩。Mega5軟件支持將比對后的序列一下子全部放到此外一個比對后的序列后面。因此在序列連接(或拼接)中,用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做連接時,要選擇Edit/Build alignment,不能是Edit/view選項,不然不能編輯。
文件輸出:
點擊FileSave As,保存為fasta格式,本例保存為123.fasta,覆蓋舊文件。
BioEdit更新日志
1:全新界面,清爽,簡單,高效
2:性能越來越好